Για να επιτευχθούν τα παραπάνω, έχει διαμορφωθεί ένα ολοκληρωμένο Σχέδιο Εργασίας το οποίο έχει δομηθεί με βάση τους κύριους στόχους του έργου. Η μεθοδολογία του έργου περιλαμβάνει την κατάρτιση επτά (7) ξεχωριστών Ενοτήτων Εργασίας (ΕΕ) με σαφώς καθορισμένους Στόχους και Παραδοτέα, τα οποία απαντούν σε συγκεκριμένες τεχνολογικές και επιστημονικές προσκλήσεις, ενώ οι δράσεις για τη διαχείριση και το συντονισμό του έργου, καθώς και οι απαραίτητες δράσεις δημοσιότητας και διάχυσης των αποτελεσμάτων θα λάβουν χώρα καθ’ όλη τη διάρκεια του έργου. Αρχικά, στο πλαίσιο των δράσεων της ΕΕ1 προτείνεται η ανάπτυξη μίας πλήρους, στοχευμένης και ενοποιημένης βάσης δεδομένων, η οποία θα περιλαμβάνει στοιχεία απαραίτητα για την εκτέλεση του έργου, και η οποία θα κοινοποιείται και θα εμπλουτίζεται με δεδομένα από όλους τους συμβαλλόμενους φορείς. Αυτή η βάση θα αποτελέσει κύριο εργαλείο αξιολόγησης και αξιοποίησης των αποτελεσμάτων που θα προκύπτουν κατά τη διάρκεια του έργου. Στην ΕΕ2 θα επιλεγούν, ύστερα από κλινική αξιολόγηση, ασθενείς με περιοδοντίτιδα και θα συλλεχθούν δεδομένα τομογραφίας κωνικής δέσμης (CBCT), τα οποία θα επεξεργαστούν στην ΕΕ3 για τη σύνταξη του τρισδιάστατου μοντέλου των σκληρών ιστών του στοματογναθικού συστήματος, αναπτύσσοντας αυτοματοποιημένη μεθοδολογία και διεπαφή ολοκληρωμένου συστήματος τρισδιάστατης απεικόνισης και αποθήκευσης των σκληρών ιστών με χρήση δεδομένων CBCT. Παράλληλα, το έργο θα προχωρήσει με την επιλογή και αξιολόγηση κατάλληλων βιοαπορροφήσιμων πολυμερών, βιοδραστικών μορίων και συνδυασμών τους, για 3D ικριώματα περιοδοντίτιδας (ΕΕ4), ενώ στην ΕΕ5 θα αναπτυχθεί μεθοδολογία τρισδιάστατης σχεδίασης, απεικόνισης και αποθήκευσης ικριωμάτων περιοδοντίτιδας, θα δημιουργηθεί σχετικό λογισμικό, θα αναπτυχθεί διαδικασία τρισδιάστατης εκτύπωσης ικριωμάτων περιοδοντίτιδας και τέλος, θα συνταχθούν και θα εκτυπωθούν τρισδιάστατα ικριώματα περιοδοντίτιδας για πολλαπλές περιπτώσεις ασθενών με βάση τα δεδομένα CBCT που θα συλλεχθούν στο πλαίσιο του έργου.

Παράλληλα με την ανάπτυξη 3D ικριωμάτων θα σχεδιαστούν, παραχθούν και χαρακτηριστούν, σε εργαστηριακό επίπεδο, συστήματα μεταφοράς φαρμάκων και επικάλυψη στα 3D ικριώματα περιοδοντίτιδας και θα μελετηθεί η διεργασία αποστείρωσης. Τέλος, τα σκευάσματα, αλλά και το λογισμικό που θα προκύψουν, καθώς και οι καινοτομίες που θα αναπτυχθούν κατά τη διάρκεια του έργου θα εκτιμηθούν οικονομοτεχνικά, ενώ παράλληλα θα καταστρωθεί σχέδιο αξιοποίησης και διάχυσης των βασικών αποτελεσμάτων, αλλά και η διαχείριση του επιχειρηματικού κινδύνου (ΕΕ7). Οι εμπλεκόμενοι φορείς θα διερευνήσουν και με βάση τα αποτελέσματα του έργου τα αντικείμενα τα οποία αξίζουν να προστατευτούν λόγω καινοτομίας και πιθανότητας μελλοντικής εκμετάλλευσης.